Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Aqp4-201ENSMUST00000079081 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CartptP56388 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm37350-201ENSMUST00000192782 313 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Olfr1328-201ENSMUST00000081960 944 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
CartptP56388 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
CartptP56388 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CartptP56388 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms