Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm44753-201ENSMUST00000207739 2335 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Dhx32-202ENSMUST00000063669 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClgnP52194 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms