Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3550W4VSN7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms