Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vstm4T1NXB5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vstm4T1NXB5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms