Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms