Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt16Q9Z2K1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt16Q9Z2K1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms