Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip6Q9Z1Y4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trip6Q9Z1Y4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms