Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
D17h6s53eQ9Z1R4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
D17h6s53eQ9Z1R4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17h6s53eQ9Z1R4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17h6s53eQ9Z1R4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17h6s53eQ9Z1R4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
D17h6s53eQ9Z1R4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17h6s53eQ9Z1R4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D17h6s53eQ9Z1R4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms