Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slfn1Q9Z0I7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slfn1Q9Z0I7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn1Q9Z0I7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms