Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F7

Sncg, Gamma-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncgQ9Z0F7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SncgQ9Z0F7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SncgQ9Z0F7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms