Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx1Q9WV80 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx1Q9WV80 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms