Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms