Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms