Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tnfsf13bQ9WU72 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf13bQ9WU72 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms