Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn5Q9WU28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn5Q9WU28 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms