Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cul1Q9WTX6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul1Q9WTX6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms