Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ggps1Q9WTN0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggps1Q9WTN0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms