Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fam50bQ9WTJ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam50bQ9WTJ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms