Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PplQ9R269 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PplQ9R269 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PplQ9R269 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PplQ9R269 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PplQ9R269 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PplQ9R269 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PplQ9R269 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PplQ9R269 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PplQ9R269 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PplQ9R269 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PplQ9R269 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PplQ9R269 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PplQ9R269 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PplQ9R269 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PplQ9R269 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PplQ9R269 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PplQ9R269 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PplQ9R269 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PplQ9R269 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PplQ9R269 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PplQ9R269 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PplQ9R269 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PplQ9R269 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PplQ9R269 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PplQ9R269 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PplQ9R269 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PplQ9R269 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PplQ9R269 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PplQ9R269 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PplQ9R269 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PplQ9R269 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PplQ9R269 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PplQ9R269 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PplQ9R269 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PplQ9R269 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms