Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TapbpQ9R233 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms