Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htra1Q9R118 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra1Q9R118 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms