Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpk1Q9R0M5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpk1Q9R0M5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpk1Q9R0M5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpk1Q9R0M5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpk1Q9R0M5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms