Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d3cQ9QZS8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d3cQ9QZS8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d3cQ9QZS8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d3cQ9QZS8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d3cQ9QZS8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh2d3cQ9QZS8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh2d3cQ9QZS8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh2d3cQ9QZS8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms