Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Npas3Q9QZQ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas3Q9QZQ0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms