Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndrg3Q9QYF9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndrg3Q9QYF9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms