Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd1Q9QY80 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms