Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxe3Q9QY14 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxe3Q9QY14 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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