Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn4Q9QXZ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn4Q9QXZ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms