Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChmQ9QXG2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms