Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Limd1Q9QXD8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Limd1Q9QXD8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms