Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim44Q9QXA7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms