Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Homer2Q9QWW1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Homer2Q9QWW1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms