Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cln8Q9QUK3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cln8Q9QUK3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms