Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2lQ9JME7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms