Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin3Q9JLB9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin3Q9JLB9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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