Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CubnQ9JLB4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CubnQ9JLB4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms