Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prg3Q9JL95 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prg3Q9JL95 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms