Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndufaf3Q9JKL4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms