Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rcan3Q9JKK0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcan3Q9JKK0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms