Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp39a1Q9JKJ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp39a1Q9JKJ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms