Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trem3Q9JKE1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem3Q9JKE1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms