Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pard6bQ9JK83 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms