Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms