Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssna1Q9JJ94 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssna1Q9JJ94 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms