Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FliiQ9JJ28 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FliiQ9JJ28 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms