Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1Q9JIT0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmbr1Q9JIT0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms