Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1fQ9JIS7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacna1fQ9JIS7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1fQ9JIS7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166 ms