Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Exosc9Q9JHI7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Exosc9Q9JHI7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Exosc9Q9JHI7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms