Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hapln2Q9ESM3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hapln2Q9ESM3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms