Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rb1cc1Q9ESK9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rb1cc1Q9ESK9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms