Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim54Q9ERP3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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